这个时候的总参谋部还是偏向于顾问机构的作用，用后世的语言来说这就是一个智库，是大汉版的兰德公司。总参谋部的骨干成员主要是原来军事研究院的师生，他们是具体办事的人。
其中内阁中懂军事的几位阁臣，例如诸葛亮、步骘、郭攸之等也兼职着里面的顾问成员，遇到一些重大的战略性决策的时候，刘厚也会召集他们参与商议。
按照刘厚原来的设想，他是想将政务与军事分开，内阁管政务但不得涉及到军事领域。军事则由总参谋部来统领。军政分开对于防止底下的官员造反有一定的积极作用。
不过，目前的情况是，原来军事研究院的学生还太年轻，经验、智谋都还不足以担当重任。大汉还缺乏足够多忠心耿耿的军事谋臣可用，所以，只能让诸葛亮他们在总参谋部兼职了。
总参谋部还有一批人员，那就是原来魏、吴两国的降臣。他们当中有些人是有真本事的，但是，他们未必就对如今的大汉有多忠心，刘厚不想浪费他们的才干，却对他们有所提防，所以将他们放在这里作为顾问的角色。
这些人虽然能接触到大汉的一些军事秘密，但是却没有实权，他们就算想干点什么也没有任何办法。他们当中典型的代表就是司马懿。