气卷入了万磁王的全人类共同进化的计划内，所以，当万磁王被捕之后，第二部的一开始，那就是讲述金刚狼前往X教授给的地址，去军方基地里，寻找自己可能遗留的痕迹。
我们会用一分钟的时间去刻画基地里的苍凉，然后，描绘一下金刚狼的遗憾。
而当他盯着废墟叹息时，一旁看起来已经损毁无用的摄像头，却忠实的将现场的一切传输了出去，接着画面闪切，本部电影的最大反派威廉-史崔克就会上线。”
“威廉-史崔克会用怀念的眼神盯着监视器上的金刚狼，因为他们本就认识。
虽然从军衔上来看他，是一名普通的美军上校，但暗地里，他却曾狠狠地捅过变种人一刀，因为他本拥有一个幸福美满的家庭，但自从他的儿子基因突变，成为了变种人后……
他们一家就被噩梦笼罩。
他儿子在觉醒之后，就拥有了制造幻象的能力，能让周围的人沉浸于幻象中不可自拔，由于无法控制自己的能力，所以他对周围的一切都造成了极大的破坏。
当威廉-史崔克的爱人，也就是变种人的亲生母亲接受不了这种连续多次的折磨后，她选择了自杀，而深爱着她的威廉-史崔克对造成这一切的儿子产生了极端的恨，他认为基因突变的变种人那就是魔鬼，在掌握权力的情况下，他想要对变种人实施报复。
因此他组建了XTeam团队，专门抓捕变种人，并进行研究。
由于这是越战之后的事情，所以，当时刚参加完越战的金刚狼也加入其中。
但因为金刚狼觉得XTeam的手段太过残忍，于是便退出了。
找了个小村庄隐居起来，遇到了自己的女友。
可金刚狼的退出，则让他成为了威廉-史崔克的目标。
归属于他的自愈能力让威廉-史崔克心动。
在威廉-史崔克的计划下，金刚狼的女友被人残忍杀害。
为了复仇，金刚狼同意接受军方的改造计划，注入了艾德曼合金。
但当金刚狼发现了XTeam和威廉-史崔克的阴谋其实是抓捕变种人，研究变种人后，被改造完毕的他便逃离了军方的基地，并且想要摧毁这一切。
而等他卷土重来时，已经研究成功的威廉-史崔克派出了死侍，和金刚狼对殴。
虽然金刚狼笑到了最后，摧毁了威廉-史崔克的变种人研究所，但他自己也失忆了，而被他杀死的死侍，也在被他斩首之后重新复活，并且脱离了
…。。