此次改造，不仅修缮了宫殿楼阁，还增建了多处亭台水榭，耗费了大量人力物力。与此同时，南赣巡抚陈察主持增筑赣州城墙，以抵御南方的盗贼侵扰。赣州城墙的增筑，增强了当地的防御能力，为维护南方的稳定起到了一定作用。
三月，云贵乡试如期举行，共录取举人55人。这些举人大多来自云贵地区的贫寒之家，他们的中举，为当地的文化发展注入了新的活力。同年，秦藩朱维焯组织刻印《史记》，历时数年，终于完成。这部刻印本的《史记》，校勘精良，印刷精美，成为后世研究《史记》的重要版本之一。
五月，西域传来消息：苏莱曼大帝率军征服美索不达米亚，占领了巴格达。马正德深知，苏莱曼大帝的扩张野心不容小觑，若不加以遏制，必将威胁到大奉的西域边境。于是，他下令让打更人组织代理西北军，加强对西域地区的控制，并开始秘密筹备西征事宜。
十月，远在欧洲的英国发生了重大变故：英王亨利八世促使国会通过《至尊法案》，宣布自己为英国国教的最高领袖，自立英国国教；托马斯·莫尔因反对该法案，被亨利八世处决。马正德得知此事后，对亨利八世的集权之举颇为赞赏，认为其“敢破陈规，不失为一代雄主”。
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永昌二十九年二月，马正德在乾清宫左右增建端凝殿与懋勤殿。端凝殿用于存放皇帝的玉玺与各类文书，懋勤殿则作为皇帝的书房与议事之所。与此同时，马正德在钦安殿奉道，每日与道士们一起诵经炼丹，崇信道教之心愈发坚定。他甚至下令，在全国范围内征召道士入宫，为自己炼制长生不老丹药。
三月，惜薪司宦官特玉等人在北京城南集资修建了一座寺庙。这座寺庙规模宏大，殿宇巍峨，特玉等人修建此寺，并非为了礼佛，而是将其作为自己日后的埋葬之所。此举引发了百官的不满，认为宦官们“僭越礼制，败坏风气”，但马正德却对此置之不理。
五月，南方诸省遭遇大水，洪水淹没了无数农田与村庄，引发了严重的饥荒。地方官府急忙开仓赈济，然而，由于洪水冲毁了道路，粮食运输困难，仍有大量百姓因饥饿而死。马正德下旨调拨国库粮食运往南方，并派官员前往灾区监督赈济工作，灾情才逐渐得到缓解。
六月，都御史顾磷将北京外城的一座城门更名为“武胜门”，意在彰显大奉的武功。与此同时，广东海道副使汪柏与葡萄牙人达成协议，规定葡萄牙人每年需向大奉缴纳一定的租金与关税，方可在澳门居住与贸易。这一协议的达成，
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