十名美女与大量粮草，美其名曰“安抚海寇”。此事被御史弹劾后，皇帝下令将阮鹗逮捕至京，经审讯属实，阮鹗被革职为民，永不叙用。
阮鹗倒台后，浙直总督胡宗宪深感不安。为稳固地位，他派人在浙江深山捕获一只白鹿，献给严嵩。白鹿在古代被视为“祥瑞之物”，严嵩见后大喜，在皇帝面前极力夸赞胡宗宪“忠心耿耿，治理海患有方”。皇帝马铭文虽对胡宗宪谄媚严嵩的行为极为不满，却因胡宗宪在抗倭战事中颇有战功，且严嵩极力维护，只得咬牙忍下，心中却已埋下了铲除严嵩的种子。
天受九年四月，数千海寇乘船进犯福建惠安。致仕知县林咸得知后，立即召集城内百姓，组织守城。惠安县城墙低矮，守军不足百人，林咸却毫无惧色，他将百姓分为两队，一队负责搬运滚木礌石，一队负责守城，自己则亲自登城指挥。
海寇连续攻城五昼夜，惠安军民死守不退，林咸虽已年逾花甲，却始终坚守在城头，甚至亲自开弓射箭，射杀数名海寇。第五日夜，海寇见久攻不下，便佯装退兵，林咸不知是计，率数十名乡兵出城追击，结果在鸭山遭遇海寇埋伏，林咸身中数箭，壮烈殉国。
林咸殉国后，大奉天军参将尹凰率水师赶到，他指挥战船围攻海寇，用火炮击沉海寇船十余艘，擒斩海寇万余人，剩余海寇乘船逃窜，惠安之围遂解。尹凰入城后，为林咸举行了隆重的葬礼，皇帝也下诏追赠林咸为“兵部尚书”，谥号“忠烈”。
五月，海寇又在浙江台州栅浦设立据点，他们在此修筑营寨，囤积粮草，四出劫掠黄岩、温岭等地。海寇所到之处，烧杀抢掠，无恶不作，百姓们纷纷逃往内地，台州境内一片狼藉。总督胡宗宪得知后，立即派戚继光、俞大猷率军前往围剿，却因海寇占据有利地形，且熟悉当地水域，官军进攻屡屡受挫。
北方边境的战火再度燃起。天受九年六月，俺答汗之子辛爱率五万骑兵围攻大同右卫。右卫城经过杨博的修缮，城墙高大坚固，守军也增至三千人，守将尚表指挥军民顽强抵抗，蒙古兵数次攻城，皆被击退。
然而，右卫城内粮草不足，难以长期坚守。朝廷得知后，紧急调拨十万石粮草与五万两白银驰援，又派杨博率大军北上。辛爱见朝廷援军将至，且右卫城久攻不下，只得撤兵北去，右卫之围遂解。
天受九年七月，总督胡宗宪集结浙江、福建水师共三万余人，由戚继光、俞大猷指挥，围攻盘踞于浙江舟山岑港的海寇。岑港地处舟山群岛，地形险要，海寇在此修筑了坚固的营
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